<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>ALKHAS;The Journal of Environment, Agriculture and Biological Sciences</title>
<title_fa>آلخاص؛ نشریه محیط زیست ،کشاورزی و علوم زیستی</title_fa>
<short_title>alkhass</short_title>
<subject>Agriculture</subject>
<web_url>http://alkhass.srpub.org</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn></journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2717-2155</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.29252/alkhass</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid></journal_id_sid>
<journal_id_nlai></journal_id_nlai>
<journal_id_science></journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1402</year>
	<month>6</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2023</year>
	<month>9</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>5</volume>
<number>3</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>en</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>تجزیه و تحلیل جزئی ژن CCDC141 در رابطه با سندرم آسیت در جوجه های گوشتی</title_fa>
	<title>Partial analysis of CCDC141 gene in relation to ascites syndrome in broilers</title>
	<subject_fa></subject_fa>
	<subject></subject>
	<content_type_fa></content_type_fa>
	<content_type></content_type>
	<abstract_fa>&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;پیشرفت ژنتیکی منجر به افزایش سرعت رشد، راندمان تغذیه و متعاقباً افزایش میزان مرگ و میر و شیوع بیماری های متابولیک مانند آسیت در جوجه های گوشتی شده است. آسیت به عنوان یکی از سه بیماری عمده متابولیک، خسارات اقتصادی قابل توجهی را در صنعت طیور ایجاد کرده است. در چند سال گذشته، با بهبود نرخ رشد، بروز آسیت به طور چشمگیری در جوجه ها افزایش یافته است. با توجه به اهمیت این بیماری به عنوان یکی از مشکلات رایج در صنعت طیور و همچنین اهمیت اقتصادی آن در مرگ و میر پرندگان، بررسی عوامل موثر در بیماری آسیت ضروری است. بیماری آسیت تحت تأثیر عوامل ژنتیکی و محیطی است. مطالعات قبلی نشان داده است که ژن CCDC141 می&#8204;تواند یک نامزد قوی در ارتباط با نارسایی قلبی و رشد آسیت در جوجه&#8204;های گوشتی باشد. بنابراین، هدف از این مطالعه بررسی ساختاری برخی از بخش&#8204;های این ژن در جوجه&#8204;های گوشتی است. برای دستیابی به این هدف، شاخص قلبی روی 120 قطعه پرنده از جمعیت جوجه های لاین B آرین مورد ارزیابی قرار گرفت. سپس DNA تمامی نمونه ها به روش نمک زدایی از بافت کبد استخراج شد. نواحی هدف این ژن با استفاده از پرایمرهای مناسب با واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) تکثیر شدند. در این مطالعه 3 پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی (SNPs) در ناحیه هدف ژن CCDC141 شناسایی شد. تحقیقات بیشتر نشان داد که یک جهش در ناحیه کد کننده اگزون 19 و دو SNP در اگزون 25 ژن CCDC141 قرار دارد. تجزیه و تحلیل آماری نشان داد که جهش نادرست در اگزون 19 (rs735294925) به طور معنی داری با شاخص بطن راست مرتبط است (004/0 &gt; P). جهش نادرست منجر به تغییر توالی اسیدهای آمینه می شود و می تواند تأثیر چشمگیری بر پایداری، شبکه پیوند هیدروژنی، دینامیک ساختاری، فعالیت و بسیاری دیگر از خواص فیزیولوژیکی مهم پروتئین ها داشته باشد. این یافته نشان می دهد که جهش معنی دار نادرست (rs735294925) یک عامل موثر در بیماری آسیت با تغییر عملکرد پروتئین ژن CCDC141 است. از نتایج این مطالعه می توان برای تسریع برنامه های اصلاحی مقاومت به آسیت در جوجه های گوشتی استفاده کرد.&lt;/div&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;Genetic progress has lead to an increase in the growth rate, feed efficiency and subsequently, increase the rate of mortality and the prevalence of metabolic diseases such as ascites in broilers. Ascites, as one of the three major metabolic diseases, has caused significant economic losses in the poultry industry. Over the past few years, as the improve growth rate, the incidence of ascites has increased dramatically in chickens. Given that, the importance of this disease as one of the common problems in the poultry industry and also its economic importance duo to bird mortality, it is necessary to study the effective factors in ascites disease. Ascites disease is influenced by genetics and environmental factors. Our previous GWAS study showed that the CCDC141 gene could be a strong candidate associated with heart failure and ascites development in broilers. Therefore, the aim of this study is the structural analysis of some parts of this gene in broilers. To achieve this goal, the cardiac index was evaluated on 120 birds of a population of Arian B-line chicks. Then, the DNA of all samples was extracted using the salting-out method from liver tissue. The target regions of this gene were amplified by polymerase chain reaction (PCR) using appropriate primers. In this study, 3 single nucleotide polymorphisms (SNPs) were identified in the target region of the CCDC141 gene. Further investigation revealed that a mutation located in coding region of exon 19 and two SNP in exon 25 of the CCDC141 gene. Statistical analysis revealed that the missense mutation in exon 19 (rs735294925) has been significantly associated with the right ventricular index (P &lt;0.004). &amp;nbsp;The missense mutation leads a change of amino acid sequence and can have a dramatic effect on stability, hydrogen bond network, conformational dynamics, activity, and many other physiologically important properties of proteins. The finding suggests that the significant missense mutation (rs735294925) is an effective factor in ascites disease by altering the protein function of the CCDC141 gene. The results of this study can be used to accelerate breeding programs for ascites resistance in broilers.&lt;br&gt;
&amp;nbsp;&lt;/div&gt;</abstract>
	<keyword_fa>سندرم آسیت, جوجه های گوشتی, ژنتیک, CCDC141</keyword_fa>
	<keyword>Ascites syndrome, Broilers, Genetics, CCDC141</keyword>
	<start_page>1</start_page>
	<end_page>5</end_page>
	<web_url>http://alkhass.srpub.org/browse.php?a_code=A--2-92&amp;slc_lang=en&amp;sid=4</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Maryam  </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Movaffagh</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مریم</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>موفق</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>Aminijavad4@gmail.com </email>
	<code>1003194753284600668</code>
	<orcid>1003194753284600668</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, Tarbiat Modares University, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Ali Akbar  </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Masoudi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>علی اکیر</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>مسعوذی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>1003194753284600669</code>
	<orcid>1003194753284600669</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, Tarbiat Modares University, Tehran, Iran </affiliation>
	<affiliation_fa>گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Rasoul </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Vaez Torshizi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>رسول</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>واعظ ترشیزی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>1003194753284600670</code>
	<orcid>1003194753284600670</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, Tarbiat Modares University, Tehran, Iran </affiliation>
	<affiliation_fa>گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
